MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ZM4 chromosome

Total Repeats: 40681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006526	CAA	2	6	248295	248300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56551148
5002	NC_006526	GTT	2	6	248303	248308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56551148
5003	NC_006526	TTA	2	6	248334	248339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56551148
5004	NC_006526	TGA	2	6	248371	248376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551148
5005	NC_006526	ATA	2	6	248406	248411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56551148
5006	NC_006526	TTG	2	6	248421	248426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56551148
5007	NC_006526	CAG	2	6	248517	248522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56551148
5008	NC_006526	AGT	2	6	248534	248539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551148
5009	NC_006526	ATA	2	6	248577	248582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56551148
5010	NC_006526	GC	3	6	248583	248588	0 %	0 %	50 %	50 %	56551148
5011	NC_006526	GGC	2	6	248602	248607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56551148
5012	NC_006526	AAC	2	6	248663	248668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56551148
5013	NC_006526	CAT	2	6	248781	248786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56551148
5014	NC_006526	TGC	2	6	248817	248822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56551148
5015	NC_006526	CATGGA	2	12	248877	248888	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56551148
5016	NC_006526	TAT	2	6	248921	248926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56551148
5017	NC_006526	ACA	2	6	248963	248968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56551148
5018	NC_006526	GATT	2	8	248983	248990	25 %	50 %	25 %	0 %	56551148
5019	NC_006526	CTT	2	6	249000	249005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56551148
5020	NC_006526	ATG	2	6	249027	249032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551148
5021	NC_006526	ATA	2	6	249141	249146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56551148
5022	NC_006526	CAC	2	6	249151	249156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56551148
5023	NC_006526	CCG	2	6	249180	249185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56551148
5024	NC_006526	ATG	2	6	249216	249221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551148
5025	NC_006526	ATT	2	6	249231	249236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56551148
5026	NC_006526	CCG	2	6	249269	249274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56551148
5027	NC_006526	CAAT	2	8	249498	249505	50 %	25 %	0 %	25 %	56551148
5028	NC_006526	CGA	2	6	249510	249515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56551148
5029	NC_006526	TTG	2	6	249516	249521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56551148
5030	NC_006526	CAG	2	6	249637	249642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56551148
5031	NC_006526	TAA	2	6	249643	249648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56551148
5032	NC_006526	GATGGC	2	12	249680	249691	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56551148
5033	NC_006526	TTA	2	6	249750	249755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56551148
5034	NC_006526	GT	3	6	249768	249773	0 %	50 %	50 %	0 %	56551148
5035	NC_006526	GCC	2	6	249875	249880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56551148
5036	NC_006526	GCCTTG	2	12	249917	249928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56551148
5037	NC_006526	AAT	2	6	249935	249940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56551148
5038	NC_006526	GGC	2	6	249941	249946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56551148
5039	NC_006526	G	6	6	250038	250043	0 %	0 %	100 %	0 %	56551148
5040	NC_006526	AAT	2	6	250073	250078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56551148
5041	NC_006526	ACAG	2	8	250136	250143	50 %	0 %	25 %	25 %	56551148
5042	NC_006526	ATT	2	6	250190	250195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56551148
5043	NC_006526	CGAC	2	8	250230	250237	25 %	0 %	25 %	50 %	56551148
5044	NC_006526	TTA	2	6	250316	250321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56551148
5045	NC_006526	AAT	2	6	250325	250330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56551148
5046	NC_006526	GAC	2	6	250378	250383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56551148
5047	NC_006526	GCC	2	6	250412	250417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56551148
5048	NC_006526	ACC	2	6	250502	250507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56551148
5049	NC_006526	GTT	2	6	250621	250626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56551148
5050	NC_006526	AAG	2	6	250671	250676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56551148
5051	NC_006526	AAC	2	6	250685	250690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56551148
5052	NC_006526	ATT	2	6	250737	250742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56551148
5053	NC_006526	TGG	2	6	250786	250791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56551148
5054	NC_006526	TTC	2	6	250811	250816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56551148
5055	NC_006526	TTC	3	9	250837	250845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56551148
5056	NC_006526	CGGCTT	2	12	250875	250886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56551148
5057	NC_006526	A	6	6	250908	250913	100 %	0 %	0 %	0 %	56551148
5058	NC_006526	AAT	2	6	250919	250924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56551148
5059	NC_006526	ACC	2	6	250970	250975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56551148
5060	NC_006526	GAC	2	6	251018	251023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56551148
5061	NC_006526	CTT	2	6	251026	251031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56551148
5062	NC_006526	AAC	2	6	251045	251050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56551148
5063	NC_006526	CGG	3	9	251059	251067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56551148
5064	NC_006526	GTC	2	6	251107	251112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56551148
5065	NC_006526	CGG	2	6	251113	251118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56551148
5066	NC_006526	AGC	2	6	251147	251152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56551148
5067	NC_006526	TCGG	2	8	251177	251184	0 %	25 %	50 %	25 %	56551148
5068	NC_006526	ACG	2	6	251262	251267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56551148
5069	NC_006526	GGCGGT	2	12	251306	251317	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	56551148
5070	NC_006526	CGG	2	6	251392	251397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56551148
5071	NC_006526	ATC	2	6	251462	251467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56551148
5072	NC_006526	TTG	2	6	251480	251485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56551148
5073	NC_006526	ATC	2	6	251640	251645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56551148
5074	NC_006526	ATA	2	6	251670	251675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56551148
5075	NC_006526	A	6	6	251739	251744	100 %	0 %	0 %	0 %	56551149
5076	NC_006526	GCG	2	6	251750	251755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56551149
5077	NC_006526	TGA	2	6	251773	251778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551149
5078	NC_006526	TCTT	2	8	251788	251795	0 %	75 %	0 %	25 %	56551149
5079	NC_006526	GTT	2	6	251803	251808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56551149
5080	NC_006526	CTG	2	6	251830	251835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56551149
5081	NC_006526	TGA	2	6	251900	251905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551149
5082	NC_006526	TGA	2	6	251924	251929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551149
5083	NC_006526	GCA	2	6	252038	252043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56551149
5084	NC_006526	TA	3	6	252141	252146	50 %	50 %	0 %	0 %	56551149
5085	NC_006526	TCGGCT	2	12	252147	252158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56551149
5086	NC_006526	GCA	2	6	252219	252224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56551149
5087	NC_006526	TGA	2	6	252313	252318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551149
5088	NC_006526	GCG	2	6	252324	252329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56551149
5089	NC_006526	GAAA	2	8	252356	252363	75 %	0 %	25 %	0 %	56551149
5090	NC_006526	TGA	2	6	252502	252507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551149
5091	NC_006526	GCA	2	6	252618	252623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56551149
5092	NC_006526	CGAAG	2	10	252638	252647	40 %	0 %	40 %	20 %	56551149
5093	NC_006526	GCA	2	6	252747	252752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56551149
5094	NC_006526	GCC	2	6	252840	252845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56551149
5095	NC_006526	GCC	2	6	252861	252866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56551149
5096	NC_006526	CAA	2	6	252876	252881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56551149
5097	NC_006526	GCG	3	9	252924	252932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56551149
5098	NC_006526	GTC	2	6	252967	252972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56551149
5099	NC_006526	CTG	2	6	253044	253049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56551149
5100	NC_006526	GC	3	6	253074	253079	0 %	0 %	50 %	50 %	56551149
5101	NC_006526	GTGA	2	8	253113	253120	25 %	25 %	50 %	0 %	56551149
5102	NC_006526	CGC	2	6	253133	253138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56551149
5103	NC_006526	CGT	2	6	253178	253183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56551149
5104	NC_006526	ATG	2	6	253205	253210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551149
5105	NC_006526	GAA	2	6	253223	253228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56551150
5106	NC_006526	CTT	2	6	253241	253246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56551150
5107	NC_006526	CTGG	2	8	253258	253265	0 %	25 %	50 %	25 %	56551150
5108	NC_006526	GATTGC	2	12	253273	253284	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56551150
5109	NC_006526	TCATG	2	10	253329	253338	20 %	40 %	20 %	20 %	56551150
5110	NC_006526	TGA	2	6	253354	253359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551150
5111	NC_006526	TTTAGG	2	12	253387	253398	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	56551150
5112	NC_006526	GAT	2	6	253475	253480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551150
5113	NC_006526	TG	3	6	253493	253498	0 %	50 %	50 %	0 %	56551150
5114	NC_006526	ATG	2	6	253506	253511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551150
5115	NC_006526	GAT	2	6	253646	253651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551150
5116	NC_006526	CCG	2	6	253681	253686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56551150
5117	NC_006526	TGCC	2	8	253800	253807	0 %	25 %	25 %	50 %	56551150
5118	NC_006526	GTTTT	2	10	253829	253838	0 %	80 %	20 %	0 %	56551150
5119	NC_006526	TGA	2	6	253845	253850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551150
5120	NC_006526	T	6	6	253859	253864	0 %	100 %	0 %	0 %	56551150
5121	NC_006526	ATT	2	6	253894	253899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56551150
5122	NC_006526	A	6	6	253913	253918	100 %	0 %	0 %	0 %	56551150
5123	NC_006526	ATT	2	6	254038	254043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56551150
5124	NC_006526	CTT	2	6	254080	254085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56551150
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5126	NC_006526	ATTTG	2	10	254124	254133	20 %	60 %	20 %	0 %	56551150
5127	NC_006526	TTG	2	6	254156	254161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56551150
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5145	NC_006526	TGA	2	6	255166	255171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551150
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5152	NC_006526	GGT	2	6	255503	255508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56551151
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5176	NC_006526	ATT	2	6	256537	256542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5222	NC_006526	ATATT	2	10	258387	258396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5223	NC_006526	AAT	2	6	258403	258408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5224	NC_006526	TGAT	2	8	258415	258422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5225	NC_006526	CTTT	2	8	258447	258454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5226	NC_006526	GAAG	2	8	258571	258578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5227	NC_006526	AAC	2	6	258645	258650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56551153
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5229	NC_006526	ATG	2	6	258728	258733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551153
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5234	NC_006526	TCT	2	6	258964	258969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56551153
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5239	NC_006526	T	7	7	259313	259319	0 %	100 %	0 %	0 %	56551154
5240	NC_006526	TTTC	2	8	259325	259332	0 %	75 %	0 %	25 %	56551154
5241	NC_006526	A	7	7	259338	259344	100 %	0 %	0 %	0 %	56551154
5242	NC_006526	A	6	6	259348	259353	100 %	0 %	0 %	0 %	56551154
5243	NC_006526	CCG	2	6	259418	259423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56551154
5244	NC_006526	GCG	3	9	259468	259476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56551154
5245	NC_006526	CAGC	2	8	259523	259530	25 %	0 %	25 %	50 %	56551154
5246	NC_006526	GGC	2	6	259544	259549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56551154
5247	NC_006526	GAT	2	6	259550	259555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551154
5248	NC_006526	CTT	2	6	259558	259563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56551154
5249	NC_006526	T	6	6	259619	259624	0 %	100 %	0 %	0 %	56551154
5250	NC_006526	TCGC	2	8	259700	259707	0 %	25 %	25 %	50 %	56551154
5251	NC_006526	CGA	2	6	259757	259762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56551154
5252	NC_006526	CTT	2	6	259855	259860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56551154
5253	NC_006526	A	6	6	259875	259880	100 %	0 %	0 %	0 %	56551154
5254	NC_006526	TTA	2	6	259933	259938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56551154
5255	NC_006526	GAA	2	6	260064	260069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56551154
5256	NC_006526	TGT	2	6	260080	260085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56551154
5257	NC_006526	AACG	2	8	260091	260098	50 %	0 %	25 %	25 %	56551154
5258	NC_006526	GTT	2	6	260208	260213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56551154
5259	NC_006526	TGA	2	6	260224	260229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551154
5260	NC_006526	GCG	2	6	260234	260239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56551154
5261	NC_006526	ATC	2	6	260248	260253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56551154
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5263	NC_006526	CG	3	6	260337	260342	0 %	0 %	50 %	50 %	56551154
5264	NC_006526	TGT	2	6	260396	260401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56551154
5265	NC_006526	TGC	2	6	260453	260458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56551154
5266	NC_006526	GAT	2	6	260529	260534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56551154
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5271	NC_006526	TAT	2	6	260805	260810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5272	NC_006526	CT	3	6	260831	260836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5273	NC_006526	TTG	2	6	260926	260931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283856215
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5275	NC_006526	TGAAG	2	10	261030	261039	40 %	20 %	40 %	0 %	283856215
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5280	NC_006526	AT	3	6	261281	261286	50 %	50 %	0 %	0 %	283856215
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5286	NC_006526	TCA	2	6	261550	261555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283856215
5287	NC_006526	TTGTT	2	10	261601	261610	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5288	NC_006526	TCG	2	6	261614	261619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5324	NC_006526	AT	3	6	263326	263331	50 %	50 %	0 %	0 %	56551159
5325	NC_006526	GGC	2	6	263426	263431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56551159
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5327	NC_006526	T	6	6	263508	263513	0 %	100 %	0 %	0 %	56551159
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5330	NC_006526	AGA	2	6	263622	263627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56551159
5331	NC_006526	T	6	6	263636	263641	0 %	100 %	0 %	0 %	56551159
5332	NC_006526	TGA	2	6	263673	263678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5333	NC_006526	TG	3	6	263718	263723	0 %	50 %	50 %	0 %	283856217
5334	NC_006526	GTT	2	6	263729	263734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283856217
5335	NC_006526	GGAT	2	8	263791	263798	25 %	25 %	50 %	0 %	283856217
5336	NC_006526	TCA	2	6	263943	263948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283856217
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5340	NC_006526	TTC	2	6	264032	264037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283856217
5341	NC_006526	ACAGTT	2	12	264143	264154	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	283856217
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5343	NC_006526	TTTA	2	8	264182	264189	25 %	75 %	0 %	0 %	283856217
5344	NC_006526	GAA	2	6	264211	264216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283856217
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5352	NC_006526	TTAT	2	8	264498	264505	25 %	75 %	0 %	0 %	283856217
5353	NC_006526	TTG	2	6	264601	264606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283856217
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5362	NC_006526	AGTAG	2	10	264771	264780	40 %	20 %	40 %	0 %	283856217
5363	NC_006526	GAA	2	6	264797	264802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283856217
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5365	NC_006526	T	6	6	264881	264886	0 %	100 %	0 %	0 %	283856217
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5496	NC_006526	TCT	2	6	269898	269903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56551164
5497	NC_006526	AGC	2	6	269969	269974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56551164
5498	NC_006526	TGC	2	6	270037	270042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56551164
5499	NC_006526	TGT	2	6	270096	270101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56551164
5500	NC_006526	ATTT	2	8	270104	270111	25 %	75 %	0 %	0 %	56551164

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